南京限价房申请流程是：申请购买保障性限价住房按照下列程序办理：申请人持《南京市保障性限价住房保障申请表》(以下简称《申请表》)向市住建委下属的保障房管理机构(以下简称“保障房管理机构”)提出申请并提交以下材料的原件和复印件：户口本和家庭成员身份证;家庭成员婚姻状况证明;家庭成员的住房情况证明;其他需提交的证明材料。保障房管理机构对申请人的家庭人员、住房等情况进行审核，并将符合条件的申请人统一公示。在公示无异议后，保障房管理机构对符合条件的申请人采取公开摇号方式确定购买资格并发放保障性限价住房购房通知书。房地产权属登记机构办理保障性限价住房登记时，应当记载“保障性限价住房”字样和准许转让日期。