花单生或2-3朵簇生于叶腋，无总花梗，白色、粉红色或紫色，单瓣或重瓣；花梗长2-2.5cm，密被柔毛；苞片线形，位于花梗的基部；侧生萼片2，卵形或卵状披针形，长2-3毫米，唇瓣深舟状，长13-19毫米，宽4-8mm，被柔毛，基部急尖成长1-2.5cm内弯的距；旗瓣圆形，兜状，先端微凹，背面中肋具狭龙骨状突起，顶端具小尖，翼瓣具短柄，长23-35mm，2裂，下部裂片小，倒卵状长圆形，上部裂片近圆形，先端2浅裂，外缘近基部具小耳；雄蕊5，花丝线形，花药卵球形，顶端钝；子房纺锤形，密被柔毛。蒴果宽纺锤形，熟时一触即裂，长10-20mm：两端尖，密被柔毛。
种子多数，圆球形，直径1.5-3毫米，黑褐色，成熟时外壳自行爆裂，将种子弹出，自播繁殖，故采种须及时。花期7～10月。[1]
凤仙花形似蝴蝶，花色有粉红、大红、紫、白黄、洒金等，善变异。有的品种同一株上能开数种颜色的花瓣。