防火分区内是可以存在有变形缝的，但变形缝应选用带有阻火圈的品种。
在高层主体建筑与配楼之间，一般留有变形缝（沉降缝、抗震缝、伸缩缝）。若将防火门设在变形缝中间，由于防火分区之间温度、地基等原因，发生火灾时，烟火易扩散蔓延成灾。因此，规定防火门设在楼层较多一侧，且向楼层较多一侧开启，以防止火焰通过变形缝蔓延而造成严重后果。
通常在多层建筑是不可能带裙房的，只有高层建筑才会有裙房。高层建筑与裙房之间一般会有变形缝，如果将高层与裙房在变形缝处用防火分区分开，裙房部分的防火分区面积可以加大，裙房楼梯也可以采用封闭楼梯间，但这和变形缝是否设在防火分区中间没关系。